D. Yu. Ryazantsev, E. M. Chudinova, L. Yu. Kokaeva, S. N. Elansky, P. N. Balabko, G. L. Belova, S. K. Zavriev
Ang phytopathogenic fungus Colletotrichum coccodes hinungdan sa peligro nga mga sakit sa mga patatas ug kamatis nga naila nga antracnose ug tuber black spot. Pinaagi sa mga kinaiya nga morphological, kanunay sila lisud mailhan gikan sa mga sakit nga gipahinabo sa ubang mga mikroorganismo; sa berde nga mga prutas nga kamatis, ang sakit mahimo’g wala’y simtomas, nagpakita ra sa mga hinog nga pula nga prutas. Alang sa dali ug tukma nga pagdayagnos sa pathogen, usa ka tibuuk nga sistema sa pagsulay sa PCR ang gitanyag. Aron mapalambo ang usa ka sistema sa pagsulay, natino ang pagkasunud sa nucleotide sa glycerol triphosphate dehydrogenase nga gen nga 45 C. coccodes nga gilain gikan sa mga tubo sa patatas sa lainlaing mga rehiyon sa Russia.
Pinahiuyon sa nakuha nga mga sangputanan ug pagtuki sa parehas nga han-ay sa uban pang mga lahi nga magamit sa database sa GenBank, gilaraw ang mga espesipikong piho nga espisye ug pakisusi alang sa C. coccodes. Aron masusi ang pagkapiho sa nahimo nga sistema sa panukiduki, gipatuman ang PCR nga adunay DNA nga nahimulag gikan sa puro nga mga kultura nga 15 nga lainlain nga mga lahi nga parasitiko ug saprotrophic fungi nga adunay kalabutan sa mga tanum nga kamatis ug patatas (Fusarium oxysporum, F. verticillium, Phomopsis phaseoli, Alternaria alternata, Helminthosporium solani, Colletotrichum coccodes Phellinus ferrugineovelutinus, Stemphylium vesicarium, Helminthosporium solani, Phomopsis phaseoli, Neonectria radicicola, Rhizoctonia solani, Penicillium sp., Cladosporium fulvum, C. cladosporioides). Ang presensya sa Colletotrichum coccodes DNA natino sa usa ka threshold cycle nga 20-27, samtang ang ubang mga species nakit-an pagkahuman sa 40 nga siklo o wala mamatikdi. Ang sistema sa pagsulay gihimo nga posible nga masaligan nga makit-an ang C. mga coccode nga konsentrasyon sa DNA nga labaw sa 0.01 ng / mm3 sa gisusi nga sagol nga PCR. Gamit ang naugmad nga sistema sa pagsulay, giimbestigahan ang presensya sa C. coccodes sa dahon sa kamatis nga adunay mga simtomas sa mga sakit nga fungal ug sa mga tubo nga wala’y panggawas nga simtomas sa sakit. Ang mga dahon nga adunay simtomas sa impeksyong fungal nakolekta gikan sa duha ka lainlaing mga uma sa Teritoryo sa Krasnodar, mga tuber - gikan sa mga uma sa mga rehiyon sa Kostroma, Moscow, Kaluga, Nizhny Novgorod. Ang usa ka dahon sa kamatis nga adunay sulud nga C. coccodes DNA nakit-an sa Krasnodar Teritoryo; hinungdanon nga presensya sa DNA sa kini nga pathogen nga nakit-an sa 5 nga mga sampol nga tubers nga gitanom sa mga rehiyon sa Kostroma, Moscow, Kaluga.
Pasiuna
Ang fungi sa henero nga Colletotrichum peligro nga mga phytopathogens nga nakaapekto sa mga lugas, utanon, utanon, perennial nga prutas ug mga tanum nga berry. Ang usa ka lahi sa tanan nga lahi sa kini nga henero nga, Colletotrichum coccodes (Wallr).
Ang Hughes, mao ang hinungdan nga ahente sa antracnose ug itom nga lugar sa mga patatas ug kamatis, ug hinungdan sa mga sakit sa daghang uban pang mga tanum sa pamilyang Solanaceae, apil na. mga sagbot (Dillard, 1992). Ang C. coccodes nag-impeksyon sa tanan nga mga ilawom sa yuta nga mga bahin sa tanum, mga base base, dahon, ug prutas (Andrivon et al., 1998; Johnson, 1994). Sa panit sa mga nataptan nga tubers nga patatas, ang pag-uswag sa mga abuhon nga mga tuldok nga adunay dili tin-aw nga gilitok nga mga ngilit nakit-an, diin ang mga itom nga tuldok nga sporulation ug microsclerotia klarong makita. Sa panahon sa pagtipig, ang mga ulser nga adunay humok nga sulud mahimong maporma sa pulp nga mga tubers, ie ang sakit mosulod sa anthracnose phase, diin, bisan pa, labi ka talagsaon.
Sa parehas nga oras, ang mga simtomas sa antracnose (ulser sa panit nga adunay gagmay nga itom nga tulbok) tipikal sa mga prutas nga kamatis. Sa mga dahon, ang mga simtomas sa C. coccodes makita ingon mga itom nga brown spot, kasagarang utlanan sa dilaw nga tisyu (Johnson, 1994).
Ang pag-uswag sa itom nga lugar sa mga tubers nakadaut sa ilang panagway, nga labi nga gilitok kung nagbaligya sa nahugasan nga red-peel nga patatas. Ang pagkutkot sa panit nagdala sa labi nga pag-alisngaw ug pagdugang nga pagkawala sa pagtipig (Gutom, McIntyre, 1979). Ang kadaot sa ubang mga organo sa tanum nagdala sa pagkawala sa ani, nga nakit-an sa parehas nga bukas ug sirado nga yuta (Johnson, 1994; Tsror et al., 1999). Ang mga sakit nga gipahinabo sa C. coccodes sagad sa hapit tanan nga mga rehiyon nga naghimo og patatas sa kalibutan, lakip ang Russia (Leesa, Hilton, 2003; Belov et al, 2018). Ang pagpugong sa kini nga mga sakit lisud tungod sa dili igo nga kaepektibo sa mga kasamtangan nga fungicides batok sa C. coccodes ug kakulang sa resistensyado nga lahi (Basaha, Itago, 1995).
Ang C. coccodes inoculum mahimong magpadayon sa mga tubers sa binhi (Basaha, Itago, 1988; Johnson et al., 1997), mga liso sa kamatis (Ben-Daniel et al., 2010), mabuhi sa dugay nga panahon sa yuta, sa mga basura sa tanum (Dillard, 1990 ; Dillard ug Cobb, 1993) ug sa mga sagbot (Raid and Pennypacker, 1987). Ang mga buhat sa daghang tagsusulat (Basaha, Itago, 1988; Barkdoll, Davis, 1992; Johnson et al., 1997; Dillard, Cobb, 1993) gipakita nga ang pag-uswag sa sakit sa patatas ug kamatis kadaghanan nagsalig sa presensya sa inoculum sa binhi ug yuta Tungod niini, aron maminusan ang pagkawala sa sakit, kinahanglan nga pag-diagnose (lakip ang kadaghan) ang mga pagsabwag sa fungus sa materyal nga binhi, sa yuta, sa mga tubo sa patatas nga binhi ug mga binhi sa kamatis nga gibutang aron tipigan. Ang mga diagnostic nga morphological sa yuta ug materyal nga tanum mahimo ra pinaagi sa presensya sa microsclerotia, nga, bisan pa, makit-an usab sa uban pang lahi nga fungi.
Ang mga simtomas sa tubers parehas sa silvery scab nga gipahinabo sa fungus Helminthosporium solani. Ang pagbulag sa mga coccode sa Colletotrichum ug Helminthosporium solani nga usa ka putli nga kultura labi ka lisud ug dugay tungod sa hinay nga pagtubo sa usa ka medium nga nutrient. Aron dali mahibal-an ang mga coccode sa Colletotrichum, kinahanglan nga gamiton ang mga pamaagi sa diagnostic nga instrumental. Ang labi ka dali nga pamaagi mao ang reaksyon sa polymerase chain (PCR) ug ang pagbag-o niini - real-time PCR. Karon, usa ka sistema sa pagsulay ang gihimo sa mga tigdukiduki sa Britain (Cullen et al., 2002) alang sa rehiyon sa ITS1 sa rDNA nga gigamit sa Europa ug Estados Unidos. Ang paggamit niini nagpakita maayong resulta sa pagtuki sa mga nahimulag sa Rusya (Belov et al, 2018). Bisan pa, ang C. coccodes labi ka lahi ug ang pagkakita niini gikan sa us aka pagsunud sa DNA mahimong mosangput sa sayup nga dili maayong mga sangputanan. Alang sa labi ka kasaligan nga pagdayagnos, kinahanglan nga analisahon ang daghang mga pagkasunud sa DNA nga lahi sa lahi, nga adunay kalabotan nga gihimo namon ang usa ka orihinal nga sistema sa pagsulay nga nagtugot kanamo sa pag-ila sa C. coccodes pinaagi sa han-ay sa gen nga glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase.
Mga materyales ug pamaagi
Aron masusi ang kaepektibo ug pagkapiho sa gimugna nga mga sistema sa pagsulay, gigamit namon ang puro nga kultura sa 15 ka lahi nga fungi nga nahimulag sa mga tagsulat gikan sa mga gisakit nga sampol sa dahon sa kamatis ug prutas, tubo nga patatas (Talaan 1) Alang sa pag-inusara, ang mga organo sa mga tanum nga adunay sintomas sa impeksyong fungal gikuha, dili molapas sa usa ka organ sa matag sapinit.
Ang usa ka hiwa sa usa ka tuber nga adunay usa ka panit, usa ka hiwa sa usa ka prutas nga kamatis, ug usa ka apektado nga dahon nga gibutang sa ilalum sa usa ka binocular microscope, pagkahuman ang mycelium, spores, o usa ka piraso sa tisyu gibalhin sa usa ka agar medium (wort agar) sa usa ka pinggan nga Petri nga adunay usa ka hait nga dissect needle. Ang mga nahamulag gitipigan sa agar slant sa mga tubo sa pagsulay nga 4 ° C.
Ang mga sampol nga dahon sa kamatis nga adunay mga simtomas sa mga sakit nga fungal, nga gituyo alang sa pagtuki, pagkahuman sa pagkolekta (sa uma) gibutang sa 70% nga etil nga alkohol diin kini gitipig hangtod nga nahimulag ang DNA. Ang mga patatas nga tubers gihatud sa laboratoryo, gipanitan (2 × 1 cm nga piraso) gikan kanila, ug gi-freeze sa –20 ° C. Gitipig nga tugnaw hangtod nga nahimulag ang DNA.
Ang mga puro nga kultura sa fungi alang sa pagbulag sa DNA gipatubo sa medium nga likido nga pea. Ang mycelium sa fungus gikuha gikan sa likido nga likido, gipauga sa filter paper, gi-freeze sa likido nga nitroheno, homogenized, gilubngan sa buffer sa CTAB, giputli sa chloroform, gipaandar sa sagol nga isopropanol ug 0.5 M nga potassium acetate, ug gihugasan duha ka beses sa 2% nga alkohol. Ang sangputanan nga DNA natunaw sa deionized nga tubig ug gitipig sa –70 ° ((Kutuzova et al., 20). Gisukod ang konsentrasyon sa DNA gamit ang usa ka HS DNA nga kwentipikasyon nga kit alang sa doble nga naka-straced nga DNA sa Qubit 2017 (Qiagen, Germany). Ang mga nahubog sa alkohol ug nabagtik nga mga sample gisulud sa likido nga nitroheno, pagkahuman gihimo ang pagkuha sa DNA sama sa gihulagway sa taas (alang sa mycelium sa puro nga mga fungal culture)
Talaan 1. Sinugdanan sa gigamit nga mga pilay sa fungi
Ngalan sa uhong | Tanum, organo | Dapit nga kapilian |
---|---|---|
Mga coccode sa colletotrichum 1, C. coccodes 2, C. coccodes 3, Ilyonectria crassa, Rhizoctonia solani | patatas tuber | Ang rehiyon sa Kostroma, mga tubo sa patatas nga una nga henerasyon sa uma, kultibado nga Red Scarlett |
Mga coccode sa Colletotrichum 4 | patatas nga panapton | Si Rep. Mari El, Yoshkar-Ola |
Helminthosporium solani | patatas tuber | Rehiyon sa Magadan, pos. Tent, tubo nga patatas |
Espesye sa tanom nga bulak ang Cladosporium fulvum | dahon sa kamatis | Ang rehiyon sa Moscow, kamatis nga adunay daghang bunga |
Espesye sa tanom nga bulak ang Alternaria tomatophila | bunga sa kamatis | gitunol sa mga kawani sa laboratoryo sa mycology ug fitopathology sa All-Russian Research Institute of Protection sa Plant |
Fusarium verticillium, Phomopsisphaseoli, Alternaria alternata, Phellinus ferrugineovelutinus, Stemphylium vesicarium, Cladosporium cladosporioides, Acrodontium luzulae, Penicillium sp. | bunga sa kamatis | Teritoryo sa Krasnodar, distrito sa Krymsky, grado nga Cream |
Espesye sa tanom nga bulak ang Fusarium oxysporum | gamot sa trigo | Rehiyon sa Moscow |
Gihimo ang PCR sa usa ka DTprime amplifier (DNA-Technology). Alang sa PCR, orihinal nga mga pasiuna ug us aka us aka us aka us aka us aka usik alang sa piho nga espisye nga rehiyon sa glycerol triphosphate dehydrogenase gene nga gigamit: gipauna nga pasiuna nga Coc70gdf –TCATGATATCATTTCTCTCACGGCA, reverse primer Coc280gdr - TACTTGAGCATGTAGGCCTGGGT1. Ang mga pasiuna nagpadako sa usa ka rehiyon nga 213 bp.
Ang reaksyon mikuha 50 ng sa kinatibuk-ang DNA (kung analisahon ang mga dahon ug tubers) ug 10 ng (kung gisusi ang DNA sa puro nga mga fungal culture). Ang sagol nga reaksyon (35 μl) gibulag sa usa ka paraffin layer ngadto sa duha nga bahin: ang labing gamay (20 μl) adunay sulud nga 2 μl nga 10 × reaksyon nga buffer (750 mM Tris-HCl, pH 8.8; 200 mM (NH4) 2SO4; 25 mM MgCl2; 0.1% Tunga- 20), 0.5 mM sa matag deoxynucleotide triphosphate, 7 pmol sa matag pasiuna, ug 4 pmol sa us aka hydrolyzable fluorescent probe; ang naa sa taas adunay sulud nga 1 μl nga 10 × PCR buffer ug 1 U nga Taq polymerase.
Ang pagbulag sa sagol nga adunay paraffin nagtugot sa mga tubo nga tipigan sa dugay nga panahon sa temperatura nga 5 ° C ug aron mahatagan usa ka mainit nga pagsugod alang sa PCR pagkahuman sa pagpainit kanila sa 10 min sa temperatura nga labaw sa 80 ° C. Gihimo ang PCR sumala sa mosunud nga programa: 94.0 ° C - 90 s (1 cycle); 94.0 ° C - 30 s; 64.0 ° C - 15 s (5 siklo); 94.0 ° C - 10 s; 64.0 ° C - 15 s (45 siklo); 10.0 ° C - pagtipig.
Mga sangputanan ug panaghisgutan
Ang han-ay sa glycerol triphosphate dehydrogenase gene natino sa 45 ka matang nga nahimulag gikan sa mga dahon, punoan, tubo sa patatas, ug mga prutas nga kamatis (Kutuzova, 2018) sa lainlaing mga rehiyon sa Russia. Ang gitun-an nga han-ay sa tanan nga mga lihok gibahin sa 2 nga mga grupo nga magkalainlain sa duha nga mga nucleotide. Ang mga pagkasunud sa nucleotide sa mga representante sa parehas nga mga grupo ubos sa numero nga KY496634 ug KY496635 gideposito sa GenBank.
Ang mga primer coc70gdf, coc280gdr ug ang cocgdz probe nga gidisenyo sa ilang sukaranan gisusi gamit ang BLAST nga programa (www.ncbi.nlm.nih.gov/blast) sa tanan nga han-ay sa glycerol triphosphate dehydrogenase nga lahi sa henero nga Colletotrichum ug uban pang mga organismo nga magamit sa database sa GenBank.
Wala nakit-an ang mga rehiyon sa DNA sa ubang mga organismo nga homologous sa mga pasiuna ug pagsusi.
Ang pagkasensitibo sa sistema sa pagsulay gisusi gamit ang mga sampol nga adunay lainlaing konsentrasyon sa C. coccodes DNA, DNA sa usa ka dahon sa patatas nga nataptan sa antracnose (nakolekta kaniadtong 2017 sa Mari El, lainlaing Pulang Scarlett), ug panit sa mga tubo nga naapektuhan sa itum nga lugar (nakolekta sa rehiyon sa Kostroma, lainlaing Pula nga Scarlett, Talaan 2). Aron makumpirma ang presensya sa DNA sa mga tubers ug dahon sa patatas, ang mga C. coccodes nga lihok gilain gikan kanila ngadto sa lunsay nga mga kultura.
Ang mga sangputanan sa pagtuki sa pagkasensitibo sa sistema sa panukiduki nagpakita nga mahimo kini magamit aron malampuson nga mahiling ang presensya sa C. coccodes DNA sa usa ka sampol kung ang kinatibuk-ang sulud sa sagol nga PCR labaw pa sa 0.05 ng. Igo na kini alang sa pagkakita, tungod kay ang usa ka sclerotia adunay sulud, sa aberids, 0.131 ng, ug ang usa ka spore adunay sulud nga 0.04 ng nga DNA (Cullen et al., 2002). Ang sistema sa pagsulay nga gihimo sa grupo nga Ingles (Cullen et al., 2002) nagpakita sa susama nga pagkasensitibo (threshold cycle 34 sa 0.05 ng DNA ug 37 sa 0.005 ng).
Ang pagtuki sa natural nga mga sampol nga adunay sulud nga C. coccodes sa tanan nga mga kaso nga gihimo nga posible nga masaligan nga mapadayag ang pagkaanaa niini sa sampol (Talaan 2). Ang gisugyot nga pamaagi alang sa pagbulag sa DNA magamit usab alang sa pagtuki sa mga natural nga sampol sa tanum.
Talaan 2. Pagtino sa pagkasensitibo sa gisugyot nga sistema sa pagsulay alang sa pag-ila sa mga coccode sa Colletotrichum alang sa real-time nga PCR
Образец | Ang kantidad sa DNA sa sample *, ng | Siklo sa threshold | C. pagkakita sa coccodes |
---|---|---|---|
Mga coccode sa Mycelium Colletotrichum | 50 | 21.3 | + |
5 | 25.7 | + | |
0.5 | 29,7 | + | |
0.05 | 33.5 | + | |
0.005 | 40 | - | |
0.0005 | 42.8 | - | |
0.00005 | - | ||
Ang panit sa tuber 1 | 50 | 32 | + |
Ang panit sa tuber 2 | 50 | 30 | + |
Ang panit sa tuber 3 | 50 | 31.5 | + |
Dahon sa patatas | 50 | 29.5 | + |
Hinumdomi * Sa pagsagol sa mga produkto sa PCR.
Ang pagkapiho sa sistema sa panukiduki gisusi sa mga sampol sa DNA nga nakuha gikan sa 15 ka klase nga fungi. Ang tanan nga mga matang sa fungi gilain sa mga tagsulat gikan sa apektado ug himsog nga prutas ug dahon sa kamatis, tubo nga tubers; ang usa nga salaan nahimulag gikan sa gamot sa trigo (Talaan 1). Lakip sa mga nahimulag gikan sa nawong sa prutas, adunay mga species nga dili pathogenic alang sa kamatis (pananglitan, Phellinus ferrugineovelutinus).
Gipakita ang mga pagtuon nga ang C. coccodes DNA nakit-an sa usa ka threshold cycle nga 20-27, samtang ang uban pang mga fungal species wala makit-an o naghatag usa ka signal pagkahuman sa siklo 40, nga mahimong ipahinungod sa usa ka dili piho nga epekto sa kasaba (Talaan 3).
Talaan 3. Pagsulay sa sistema sa pagsulay alang sa lainlaing mga lahi sa uhong
Ngalan sa uhong | Siklo sa threshold |
Mga coccode sa Colletotrichum 1 | 20.9 |
C. mga coccode 2 | 22.6 |
C. mga coccode 3 | 23 |
C. mga coccode 4 | 22 |
Espesye sa tanom nga bulak ang Fusarium oxysporum | > 40 |
F. bertikalillium | > 40 |
Espesye sa tanom nga bulak ang Rhizoctonia solani | > 40 |
Phomopsis phaseoli | > 40 |
Alternaria alternata | > 40 |
A. tomatophila | > 40 |
Helminthosporium solani | > 40 |
Espesye sa tanom nga bulak ang Phellinus ferrugineoveltinus | > 40 |
Espesye sa tanom nga bulak ang Stemphylium vesicarium | > 40 |
Ilyonectria crassa | > 40 |
Espesye sa tanom nga bulak ang Cladosporium cladosporioides | > 40 |
C. fulvum | > 40 |
Espesye sa tanom nga bulak ang Acrodontium luzulae | > 40 |
Penicillium sp. | > 40 |
Hinumdomi * Ang kantidad sa DNA sa tanan nga mga sampol mao ang 10 ng.
Ang naugmad nga sistema sa pagsulay gigamit aron maila ang mga C. coccode sa mga sampol nga dahon sa kamatis nga adunay mga simtomas sa mga necrotrophic pathogens ug seed potato tubers nga wala makita nga mga simtomas. Alang sa pagtuon, nagkuha kami mga binhi nga tubo nga lainlain nga lahi nga gipananom sa mga rehiyon sa Kostroma, Moscow, Kaluga, Nizhny Novgorod. Ang presensya sa C. coccodes DNA gikonsiderar nga kasaligan sa mga sampol, diin ang pagtuki diin ang siklo sa threshold dili molapas sa 35. Kini nga kantidad sa threshold gipili pinahiuyon sa masaligan nga pagtino nga 0.05 ng C. coccodes DNA (threshold cycle 33.5, Talaan 2) ug ang tinuod nga ang mga siklo sa threshold nga labaw sa 40, wala mahibal-an nga DNA sa ubang mga lahi sa fungi nga nadayagnos. Sa kini nga pamaagi, usa ka hinungdanon nga presensya sa C. coccodes DNA ang nakit-an sa 5 nga mga sampol nga tubers nga gitanom sa mga rehiyon sa Kostroma, Moscow, Kaluga ug sa usa ka dahon sa kamatis gikan sa distrito sa Yeisk sa rehiyon sa Krasnodar (Mga Talaan 4, 5).
Talaan 4. Nakita ang mga coccode sa Colletotrichum sa mga tubers nga patatas *
Sample nga numero | Mga patatas nga lainlain | Dapit sa pagtubo | C. pagkakita sa coccodes | Siklo sa threshold |
---|---|---|---|---|
1 | Pula nga iskarlata | Rehiyon sa Kostroma | + | 35 |
2 | + | 35 | ||
3 | - | 38 | ||
4 | Sante | Rehiyon sa Moscow | + | 34 |
5 | - | |||
6 | - | 41 | ||
7 | - | 41.8 | ||
8 | + | 30 | ||
9 | Sayo sa Zhukovsky | Rehiyon sa Moscow | - | 40.5 |
10 | - | 40.6 | ||
11 | - | |||
12 | Si Molly | Rehiyon sa Kaluga | + | 34.3 |
13 | - | 38.4 | ||
14 | Pantasya | Rehiyon sa Kaluga | - | |
15 | Gala | Nizhny Novgorod rehiyon | - | |
16 | - |
Hinumdomi * Ang kantidad sa DNA sa tanan nga mga sampol mao ang 50 ng.
Talaan 5. Nakita ang mga coccode sa Colletotrichum sa mga dahon sa kamatis *
Sample nga numero | Dapit sa pagtubo | C. pagkakita sa coccodes | Siklo sa threshold |
---|---|---|---|
1 | Teritoryo sa Krasnodar, Distrito sa Crimean | - | |
2 | - | ||
3 | - | ||
4 | - | 45 | |
5 | - | ||
6 | - | ||
7 | - | ||
8 | - | ||
9 | Teritoryo sa Krasnodar, Distrito sa Yeisk | - | 39.2 |
10 | - | 40.8 | |
11 | - | ||
12 | - | 41.6 | |
13 | - | 40 | |
14 | - | 41 | |
15 | - | 41.9 | |
16 | - | ||
17 | - | ||
18 | - | 40.3 | |
19 | - | ||
20 | - | ||
21 | + | 34.5 | |
22 | - | ||
23 | - |
* Ang kantidad sa DNA sa tanan nga mga sample 50 ng.
Ang sistema sa pagsulay nga gihimo sa amon dili mubu sa gipatubo sa mga tigdukiduki sa Britain (Cullen et al., 2002) sa pagkasensitibo ug pagkapiho ug angay alang sa pagtuki sa mga sampol sa tanum. Ang aplikasyon niini alang sa pagtuki sa mga tubo sa binhi nga nagpaposible nga makilala ang C. coccodes DNA sa mga tubers nga wala’y mga timaan nga kadaot sa gawas ug aron malampuson nga masusi ang impeksyon sa mga dahon.
Hangtod karon, wala’y pagtuki sa mga patatas nga tubers alang sa pagsulud sa C. coccodes nga gihimo sa Russia. Gipakita sa among una nga pagtuon nga gikan sa 16 nga gisulayan nga mga tubers sa binhi nga gitanom sa lainlaing mga rehiyon sa Russian Federation, 5 ang adunay C. coccodes. Gipakita niini nga ang itum nga lugar sa mga tubo nga patatas usa ka kasagarang sakit sa patatas sa Russia, ug ang papel niini sa pagminus sa kadaghan ug kalidad sa tanum nga patatas gipakamenos.
Ang pagtuki sa mga dahon sa kamatis nagpadayag usa ka hinungdanon nga presensya sa C. coccodes DNA sa usa ka dahon gikan sa distrito sa Yeisk sa Teritoryo sa Krasnodar. Sa sayo pa, sa pagsusi sa mga natad sa kamatis sa southern Russia nga gigamit ang British test system (Cullen et al., 2002), nakit-an ang mga dahon nga adunay mga C. coccode, ug sa pila ka mga uma nakita ang taas nga proporsyon sa mga dahon nga nataptan sa C. coccodes (Belov et al., 2018). Sa Krasnodar ug Primorsky Territories, ang Rehiyon sa Moscow, nakit-an namon ang mga prutas nga kamatis, diin gikan niini napahimulag namon ang puro nga mga kultura sa C. coccodes. Posible nga ang C. coccodes labi ka lapad sa kamatis sa Rusya kaysa karon nga gitoohan, ug ang pagkadautan niini wala usab hatagan pagtamod.
Sa ingon, hangtod karon, igo nga kasayuran ang natipon sa kaylap nga pag-apod-apod sa C. coccodes sa patatas ug kamatis.
Aron labi nga masabtan ang papel sa kini nga fungus sa pagpalambo sa mga sakit nga patatas ug kamatis, daghang pagsubay sa pagkaylap niini sa Russia, pagtuon sa papel sa impeksyon sa yuta ug binhi, ug ang papel sa itom nga lugar sa pagkawala sa panahon sa pagtipig gikinahanglan. Ang paggamit sa mga diagnostic sa PCR mahimong hinungdanon kaayo ang kini nga trabaho, ug ang dungan nga paggamit sa pareho nga mga sistema sa pagsulay labi nga madugangan ang pagkasibu sa pagtuki.
Ang kini nga buluhaton gisuportahan sa usa ka hatag gikan sa Russian Science Foundation No. 18-76-00009.
Ang artikulo gimantala sa journal nga "Mycology and Phytopathology" (volume 54, No. 1, 2020).